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BLAST-Algorithmus

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BLAST-Algorithmus
Software
Artículo WikipediaFuente Dbpedia
BLAST (Abk. für engl. Basic Local Alignment Search Tool) ist der Überbegriff für eine Sammlung der weltweit am meisten genutzten Programme zur Analyse biologischer Sequenzdaten. BLAST wird dazu verwendet, experimentell ermittelte DNA- oder Protein-Sequenzen mit bereits in einer Datenbank vorhandenen Sequenzen zu vergleichen. Als Ergebnis liefert das Programm eine Reihe lokaler Alignments, d.h. Gegenüberstellungen von Stücken der gesuchten Sequenz mit ähnlichen Stücken aus der Datenbank. Darüber hinaus gibt BLAST an, wie signifikant die gefundenen Treffer sind. Die Suche in der Datenbank erfolgt entweder über eine Webschnittstelle oder mit Hilfe von verschiedenen Stand-Alone-Programmen, die lokal installiert werden können.Das Programm BLAST wurde von Stephen Altschul, Warren Gish, David J. Lipman, Webb Miller und Eugene Myers an den National Institutes of Health entwickelt. Beteiligt an der Algorithmenentwicklung war auch Samuel Karlin.
Ultima versión de lanzamiento 2.2.29+
Wikipedia Inglés http://en.wikipedia.org/wiki/BLAST
Wikipedia Español http://es.wikipedia.org/wiki/BLAST
Enlaces externos relacionado ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/agarwala/windowmasker/windowmasker_suppl.pdf http://archimedes.cheme.cmu.edu/?q=gpublast http://bighost.area.ba.cnr.it/BIG/GCGManual/xnu.html http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download http://blast.wustl.edu/ http://fsa-blast.sourceforge.net/ http://mitc-openbio.sourceforge.net/ http://omics.pnl.gov/software/ScalaBLAST.php http://www.advbiocomp.com/blast.html http://www.clcbio.com/wp-content/uploads/2012/01/CLC_pressrelease_100112.pdf http://www.comp.hkbu.edu.hk/~chxw/software/G-BLASTN.html http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2007/14/pdb.top17 http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/eda/section3/eda366g.htm http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/FieldGuide/BLOSUM62.txt http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/BLASTinfo/Seg.html http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1734/ http://www.nvidia.com/object/blastp_on_tesla.html http://www.timelogic.com http://www.timelogic.com/decypher_blast.html

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Fecha publicación: 15.4.2015

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