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Basic local alignment search tool

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Basic local alignment search tool
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In bioinformatica, BLAST (Basic Local Alignment Search Tool, ovvero strumento di ricerca di allineamento locale) è un algoritmo usato per comparare le informazioni contenute nelle strutture biologiche primarie, come ad esempio le sequenze proteiche o le sequenze nucleotidiche delle molecole di DNA. Una ricerca BLAST permette al ricercatore di confrontare una sequenza di interesse con un database di sequenze già conosciute, e di identificare tra queste ultime quelle che presentano delle somiglianze con la sequenza di interesse. Ad esempio, in seguito alla scoperta di un gene di topo, prima sconosciuto, gli scienziati tipicamente compiono una ricerca BLAST nel genoma umano per vedere se contiene geni con sequenze somiglianti; una volta trovati i due geni "affini" si può indagare sperimentalmente la funzione di quello proveniente dal topo e ottenere così indizi sulla possibile funzione di quello umano.
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Wikipedia Inglés http://en.wikipedia.org/wiki/BLAST
Wikipedia Español http://es.wikipedia.org/wiki/BLAST
Enlaces externos relacionado ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/agarwala/windowmasker/windowmasker_suppl.pdf http://archimedes.cheme.cmu.edu/?q=gpublast http://bighost.area.ba.cnr.it/BIG/GCGManual/xnu.html http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download http://blast.wustl.edu/ http://fsa-blast.sourceforge.net/ http://mitc-openbio.sourceforge.net/ http://omics.pnl.gov/software/ScalaBLAST.php http://www.advbiocomp.com/blast.html http://www.clcbio.com/wp-content/uploads/2012/01/CLC_pressrelease_100112.pdf http://www.comp.hkbu.edu.hk/~chxw/software/G-BLASTN.html http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2007/14/pdb.top17 http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/eda/section3/eda366g.htm http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Class/FieldGuide/BLOSUM62.txt http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/BLASTinfo/Seg.html http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1734/ http://www.nvidia.com/object/blastp_on_tesla.html http://www.timelogic.com http://www.timelogic.com/decypher_blast.html

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Fecha publicación: 15.4.2015

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