224266 materialEducativo

The Ensembl genome database project.

tipo de documento Articulo Wikipedia Base de datos biológica

Me gusta 0
Visitas 60
Comentarios 0
Guardar en
Acciones
- Enviar enlace

Acerca de este recurso...

Base de datos biológica

Ensembl es un proyecto de investigación bioinformática que trata de "desarrollar un sistema de software que produzca y mantenga anotaciones automáticas en los genomas eucariotas seleccionados". Funciona como una colaboración entre el Wellcome Trust Sanger Institute y el Instituto Europeo de Bioinformática, una división del Laboratorio Europeo de Biología Molecular. Toda la información y software generados en el proyecto es de libre uso y acceso.La mayoría del software producido y utilizado se escribe en el lenguaje de programación Perl, y se basa en las librerías BioPerl. La Application programming interface de Perl puede utilizarse fácilmente en otros proyectos genómicos, por ejemplo en la anotación de genes o listas de clones. También hay disponible una API para Java.Los genomas anotados incluyen los vertebrados más completos, y organismos modelo seleccionados. Actualmente se incluyen: Cordados Mamíferos: Humano, Ratón, Rata, Chimpancé, Macaco, Perro, Vaca, Elefante, Colicorto (borrador). Aves: Gallina, pavo, pato, diamante mandarín. Peces: Takifugu rubripes (Fugu), Tetradodon nigroviridis, Danio rerio (Pez cebra). Anfibios: Xenopus tropicalis. Ascidias: Ciona intestinalis, Ciona savignyi Invertebrados Insectos: Anopheles gambiae (Mosquito), Abeja, Drosophila melanogaster (Mosca de la fruta). Gusanos: Caenorhabditis elegans. Levaduras: Saccharomyces cerevisiae (Levadura del pan).Este servicio se utiliza por los biólogos moleculares y bioinformáticos de todo el mundo que trabajan con genomas de las especies listadas. Las predicciones de codificación, control y otros elementos en los genomas pueden compararse con datos de investigaciones primarias y con fuentes primarias de conocimiento genómico actualizado (bases de datos biológicas). La sintenia es de valor educativo en los colegios.

Wikipedia Español http://es.wikipedia.org/wiki/Ensembl

Wikipedia Inglés http://en.wikipedia.org/wiki/Ensembl

Enlaces externos relacionado http://genome.ucsc.edu http://pre.ensembl.org http://vega.sanger.ac.uk http://www.ensemblgenomes.org http://www.ebi.ac.uk/training/online/course/ensembl-browsing-chordate-genomes http://www.ensembl.org/ http://www.ensembl.org/info/docs/api/index.html http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ftp://ftp.ensembl.org/