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HMMER

HMMER is a free and commonly used software package for sequence analysis written by Sean Eddy. Its general usage is to identify homologous protein or nucleotide sequences. It does this by comparing a ...

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Rfam

Rfam is a database containing information about non-coding RNA (ncRNA) families and other structured RNA elements. It is an annotated, open access database hosted by the Wellcome Trust Sanger Institut ...

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Pfam

Pfam è un database di famiglie di proteine che include le loro annotazioni e gli allineamenti di sequenze multiple generati usando i modelli di Markov nascosti.